Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms