Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms