Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RRBP1Q9P2E9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms