Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC40.84■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC40.82■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
CCDC180Q9P1Z9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC40.81■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC40.78■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC40.78■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC40.78■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
CCDC180Q9P1Z9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms