Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKD2L1Q9P0L9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms