Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DLL3Q9NYJ7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms