Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PAK1IP1Q9NWT1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms