Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms