Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMBRD1Q9NUN5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms