Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms