Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.51■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TULP4Q9NRJ4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms