Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NRIP3Q9NQ35 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms