Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAV7

GRPEL1, GrpE protein homolog 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRPEL1Q9HAV7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRPEL1Q9HAV7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms