Protein–RNA interactions for Protein: Q9H300

PARL, Presenilins-associated rhomboid-like protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARLQ9H300 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARLQ9H300 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms