Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF3Q9H094 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF3Q9H094 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms