Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms