Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTR3CQ9C0K3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms