Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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