Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZC3H12CQ9C0D7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZC3H12CQ9C0D7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZC3H12CQ9C0D7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZC3H12CQ9C0D7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZC3H12CQ9C0D7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms