Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRCC1Q9C099 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRCC1Q9C099 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms