Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRNKL1Q9BZJ0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms