Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BCO2Q9BYV7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BCO2Q9BYV7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms