Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms