Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDUFAF3Q9BU61 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms