Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TINF2Q9BSI4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms