Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIOK1Q9BRS2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms