Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms