Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM7Q9BQ49 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms