Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED2Q99967 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED2Q99967 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms