Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN18Q96SJ8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms