Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUDCD1Q96RS6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUDCD1Q96RS6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms