Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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