Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD27Q96NW4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms