Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD4Q96M96 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD4Q96M96 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms