Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NEURL4Q96JN8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEURL4Q96JN8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEURL4Q96JN8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEURL4Q96JN8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEURL4Q96JN8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms