Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEIL1Q96FI4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms