Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXO17Q96EF6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms