Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKL1Q969V6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKL1Q969V6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKL1Q969V6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKL1Q969V6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKL1Q969V6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKL1Q969V6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKL1Q969V6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKL1Q969V6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKL1Q969V6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKL1Q969V6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKL1Q969V6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKL1Q969V6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKL1Q969V6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MKL1Q969V6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKL1Q969V6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKL1Q969V6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKL1Q969V6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKL1Q969V6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKL1Q969V6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKL1Q969V6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms