Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25Q93038 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFRSF25Q93038 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFRSF25Q93038 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFRSF25Q93038 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25Q93038 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25Q93038 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25Q93038 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25Q93038 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25Q93038 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25Q93038 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25Q93038 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25Q93038 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25Q93038 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25Q93038 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25Q93038 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25Q93038 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25Q93038 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25Q93038 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25Q93038 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25Q93038 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25Q93038 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25Q93038 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25Q93038 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms