Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms