Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
TRIM41Q8WV44 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms