Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHDC9Q8NEP7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms