Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00116Q8NCU8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00116Q8NCU8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms