Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms