Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms