Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPAP2Q8IXW5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms