Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms