Protein–RNA interactions for Protein: Q86U37

LINC01551, Uncharacterized protein encoded by LINC01551, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01551Q86U37 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01551Q86U37 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01551Q86U37 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01551Q86U37 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01551Q86U37 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01551Q86U37 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01551Q86U37 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01551Q86U37 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01551Q86U37 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01551Q86U37 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01551Q86U37 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01551Q86U37 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01551Q86U37 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01551Q86U37 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01551Q86U37 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01551Q86U37 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms