Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTU1Q7Z7A3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms