Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms